армянских войск на Агдам 3–4 июля и успешное контрнаступление 5–7 июля 1993 г. сыграли с азербайджанскими войсками злую шутку, так как у многих появилась уверенность, что армянским войскам нанесён серьёзный ущерб и они не будут в состоянии в ближайшее время провести новое массированное наступление.
Для укрепления обороны Агдама с 12 июня 1993 г. в район перебрасывались резервы: так были переброшены 776-й ОРБ, 777-й БСПН, 888-й МСБ, подразделение морской пехоты и ряд других подразделений. Для усиления позиций 709-й ОМСБР из Агдеринского района к с. Тарнюот был переброшен 2-й МСБ 709-й ОМСБР под командованием Мурада Гурбанова. С южного направления стык Агдамского и Агджабединского районов был усилен батальоном 704-й МСБР, перед которым была поставлена задача отбить возможную атаку противника в Агджабединском направлении. Все эти подразделения принимали участие в оборонительных боях в Агдамском районе. Таким образом, азербайджанское командование направляло для обороны Агдама все наличные боеготовые подразделения.
После 8 июля 1993 г. на Агдамском направлении наступило затишье, активных боевых действий не велось. 12 июля 1993 г. в регион с инспекцией и оценкой ситуации приехала комиссия Минской группы ОБСЕ во главе с Марио Рафаелли. Осмотрев сам город и прилегающие сёла, комиссия во главе с Марио Рафаелли уехала.
К сожалению, борьба за власть не обошла и сам Агдамский район. Даже в условиях массированного наступления армян, угрозы оккупации Агдама в районе не смогли удержаться от борьбы за власть и хотя бы на время армянского наступления объединиться для защиты города. 15 июля 1993 г. группа вооружённых людей во главе с директором Агдамского комбината стройматериалов Гасымом Керимовым свергла главу исполнительной власти Агдамского района Надира Исмаилова и, захватив здание администрации района, провозгласила главой исполнительной власти Агдамского района Гасыма Керимова. При этом удручало то, что в эти махинации были втянуты и некоторые офицеры Азербайджанской армии, в том числе и военнослужащие 709-й ОМСБР. Так, к истории с получением денежных средств за помощь в назначении главой исполнительной власти оказались причастны некоторые военнослужащие844. То есть, с одной стороны, шло наступление армян на Агдам, а с другой стороны, в самом Агдаме шла яростная борьба за власть.
15–16 июля 1993 г., после отъезда комиссии Минской группы ОБСЕ и очередной перегруппировки сил, подтянув подкрепления, армянские войска снова перешли в наступление, нанося основной удар с захваченных на севере Агдамского района позиций. В ходе наступления армянам удалось захватить сёла Кызыл Кенгерли, Максудлу, Шахбулаг, Тарноют, а также важные высоты Чабандаг, Еддихырман, Боздаг. Азербайджанским войскам удалось удержать основные позиции вблизи города, но все важные высоты вокруг города были уже в руках армянских войск. Таким образом, противник сжимал клещи и сужал азербайджанским войскам оперативный простор. На тот момент Агдам уже представлял собой котёл, наверху которого сидели армяне. Не отбросив армян за высоты, окаймляющие город, об обороне Агдама говорить было нечего. Фактически его судьба уже была предрешена. Спасти положение могло только контрнаступление, но сил на такую операцию уже не было. Какой-то план контратаки с целью исправления положения вокруг города готовился, но далее разговоров и планирования дело не пошло.
21 июля армянские войска после сильной артподготовки начали новое наступление на Агдам, нанося удар с трёх направлений: с северного участка со стороны с. Шахбулаг, с центрального участка со стороны Аскеранского района, с южного участка со стороны Мартунинского района. В первый день наступления противнику удалось захватить Муганлы и Сайбалы к югу от города. 22 июля 1993 г., продолжая наступление с трёх направлений, противнику удалось также захватить село Гияслы к северу от города, сёла Хыдырлы, Гасымлы и Шелли к западу от города и сёла Сарыджалы, Мурадбейли, Новрузлу и Юсифджанлы к югу от города. Фактически создалась угроза окружения города. 23 июля 1993 г. азербайджанские войска начали покидать город. Примерно в 17:00 23 июля 1993 г. Агдам и прилегающие сёла были захвачены противником. Части Азербайджанской армии отступили в направлении сёл Гейтепе – Эйвазханбейли и Зангишалы – Афатли. После 43 дней ожесточённых боёв армянским войскам удалось оккупировать Агдам и сёла около города.
После захвата Агдама армяне основную силу своего летнего наступления перенесли на юго-западное направление. В Агдамском направлении ими в конце июля 1993 г. была проведена локальная наступательная операция, в ходе которой были захвачены сёла Гейтепе, Эйвазханбейли, Косалар, Каракашлы, Ширванлы, Шишпапахлар и Конзавод, а линия фронта была отодвинута от Агдама ещё на 6 км на восток. С конца июля 1993 г. линия фронта в Агдамском районе стабилизировалась на линии Гюллюджа – Джавахирли – Чеменли – Зангишалы – Афатли.
После оккупации Агдама азербайджанским командованием несколько раз рассматривалась возможность проведения контрнаступательной операции с целью освобождения города. Но предпринятая в конце июля операция результатов не дала, а в ходе контрудара армянских войск азербайджанские войска были отброшены от Агдама ещё на 6 км. Вот как описывает обстановку на Агдамском направлении в августе командир батальона Герай Асадов: «В августе 1993 г. мой батальон в составе 701-й бригады находился на Муровдаге. Я обратился к командующему фронтом генералу З. Рзаеву с предложением начать атаку со стороны Муровдага на Кельбаджар. Такая атака привела бы к тому, что армянам пришлось бы перебросить часть своих войск из Агдама и Физули на Кельбаджарское направление. Но командующий фронтом З. Рзаев сказал, что мы пока не можем наступать на Кельбаджарское направление. 15 августа 1993 г. мой батальон был переброшен на Агдамское направление для укрепления обороны на линии Чеменли – Сарыджалы. Прибыв на Агдамское направление, я обнаружил, что войска, занимающие оборону, находятся в неудовлетворительном состоянии: инженерное оборудование местности не проводилось, в подразделениях имелся большой некомплект, дисциплина и моральное состояние войск были на низком уровне, командиры батальонов 708-й бригады приказы командира бригады исполняли ненадлежащим образом. Принятыми мерами удалось укрепить оборону на Агдамском направлении. 19 августа 1993 г. в Гяндже Суретом Гусейновым проводилось совещание командного состава армии. На нём С. Гусейнов поставил задачу в течение нескольких дней освободить Агдам. Но провести операцию не удалось, так как сил и средств для проведения такой широкомасштабной операции не было»845.
Опыт боёв за Агдам свидетельствовал о том, в каком состоянии (невысокая боевая устойчивость, стойкость и низкие морально-волевые качества) находились подразделения НАА на линии фронта, когда, даже имея численное превосходство над противником, им не удалось удержать стратегически важный город Агдам. Наиболее примечательно тут интервью бывшего командира 704-й ОМСБР Микаила Гаджиева о том, как 4 августа он был в штабе фронта, где в его присутствии командующий фронтом З. Рзаев приказал начальнику штаба фронта, полковнику Н. Намазову, срочно выдвинуться в Барду и вернуть на боевые позиции 709-ю бригаду, которая ушла с линии
