Ещё раз подчёркиваю: в то время Азербайджан находился на грани гражданской войны. Правительство НФА обратилось за помощью к Гейдару Алиеву, который 15 июня 1993 г. был избран председателем Верховного Совета. 17 июня 1993 г. президент и Верховный главнокомандующий Вооружёнными силами Азербайджана Абульфаз Эльчибей сбежал из Баку в своё родное село Келеки в Нахичевани. 24 июня 1993 г. Гейдар Алиев решением парламента стал исполняющим обязанности президента.
30 июня 1993 г. Сурет Гусейнов был назначен премьер-министром. Одновременно постановлением Милли Меджлиса № 633 от 30 июня 1993 г. в целях укрепления оборонной мощи Азербайджана в период войны и обеспечения скорейшего освобождения его оккупированной территории министерство обороны, министерство внутренних дел и министерство национальной безопасности были переданы в подчинение премьер-министру825. Таким образом все вопросы, связанные с организацией обороны страны, управление всеми силовыми структурами были переданы в подчинение премьер-министру Сурету Гусейнову. По его представлению министрами внутренних дел и национальной безопасности были назначены Вагиф Новрузов и Нариман Имранов. Прямое управление министерством обороны он оставил за собой. Также по его инициативе был создан фронт боевых действий и полевое управление фронта. Командующим фронтом – первым заместителем министра обороны – был назначен генерал-майор Задир Рзаев, начальником штаба полевого управления фронта был назначен генерал-майор Наджмеддин Садыхов826. Почему Сурет Гусейнов сразу не назначил министра обороны, почему оставил полковника Сафара Абиева начальником Генштаба, почему именно Задира Рзаева назначил командующим фронтом, почему назначил Наджмеддина Садыхова начальником штаба фронта и пр. – все эти вопросы так и остаются.
Также надо отметить, что после правления НФА был полный развал в организации обороны страны. Постоянные чистки в армии, привлечение вооружённых сил к решению внутриполитических проблем и использование их для карательных операций внутри страны, события 4 июня 1993 г. в Гяндже, столкновения между разными частями и подразделениями армии, которые выступали на стороне разных политических сил, оказали огромное негативное и деморализующее влияние на состояние армии. Многие части и подразделения были не боеготовы и неспособны выполнять задачи по предназначению. Подготовленных резервов не было. Поэтому Сурету Гусейнову надо было фактически с нуля начинать работу по организации работы МО и Генштаба, организации работы по оперативной, боевой и мобилизационной подготовке; выстраиванию организационно-штатной структуры и состава; по укреплению организованности и воинской дисциплины. И это всё надо было делать срочно и безотлагательно, т. к. уже полным ходом шло широкомасштабное наступление армянских войск.
Конечно, уже с позиций настоящего времени надо признать, что после назначения премьер-министром Сурета Гусейнова было много надежд, что он сможет переломить ход войны. Все помнили, что под его руководством летом 1992 г. были проведены успешные наступательные операции, в ходе которых были освобождены большие территории в Нагорном Карабахе. Казалось, что после того, как он стал премьер-министром и в его подчинение были переданы все силовые структуры и вопросы организации обороны страны, он сможет, как и летом 1992 г., организовать успешное ведение боевых действий со стороны Азербайджана. Но на практике неудачный ход войны переломить не удалось. За время, пока военные вопросы были в ведении премьер-министра С. Гусейнова, армянские войска захватили ещё 5 районов. Причину этого надо в первую очередь искать в грубых кадровых ошибках Сурета Гусейнова: так, назначение министром внутренних дел Вагифа Новрузова, министром национальной безопасности – своего родственника Наримана Имранова, решение оставить на посту начальника Генерального штаба – полковника Сафара Абиева, создание Карабахского фронта под командованием генералов Задира Рзаева и Наджмеддина Садыхова, конечно же, были ошибочными. Данные люди оказались неспособны организовать работу на вверенных участках надлежащим образом. Ещё одним важным аспектом было то, что летом 1992 г. войскам под командованием С. Гусейнова оказывали активную поддержку российские войска, в частности 104-я ВДД827. Летом 1993 г. российских войск на территории Азербайджана уже не было, и С. Гусейнову не к кому было обратиться за поддержкой в трудные моменты.
Также, кроме военных вопросов, в ведении С. Гусейнова были и экономические вопросы. Одно дело – быть командиром корпуса и отвечать только за ведение боевых действий в Нагорном Карабахе, а совсем другое дело – быть премьер-министром и отвечать не только за все военные вопросы в стране, но и за все социально-экономические вопросы всей страны. Кроме военных вопросов, надо было также решать вопросы обустройства сотен тысяч беженцев, невыплаты зарплаты, снабжения хлебом населения, нехватки наличных в банках и пр.828 Также С. Гусейнов вызвался решить проблему с А. Гумбатовым и провозглашённой им Талыш-Муганской Республикой829. Но, несмотря на все попытки, решить данный вопрос ему так и не удалось.
Решить этот ворох сложных военных и экономических проблем можно было бы только при наличии сильной управленческой команды. Но, как и в вопросе силовых структур, С. Гусейнов окружил себя малокомпетентными людьми вроде М. Абдулаева, В. Новрузова, А. Омарова, С. Садыхова, С. Мамедова и прочих, которые полностью завалили вверенные им участки работы. Особенно странным был факт того, что, став премьер-министром, он оставил на постах многих министров и вице-премьеров многих ставленников НФА, власть которого сам же недавно сверг. Естественно, люди, назначенные на свои посты ещё Эльчибеем, не могли простить свержения своего президента. С их стороны начался тихий саботаж. В результате летом 1993 года С. Гусейнов оказался под ворохом сложных военных и экономических проблем, решить которые он оказался неспособен. Главная причина тут, без сомнения, в провальной кадровой политике самого Сурета Гусейнова.
Поражения на Карабахском фронте сильно ударили по авторитету премьер-министра. Он обещал взять Карабах, ему были поручены вопросы организации обороны страны, но военные поражения сильно поколебали его позиции. Также сильный удар по его позициям нанесли факты противоправных действий и самоуправства, которые в Агдамском районе совершили верные ему военные силы.
Сам С. Гусейнов отрицает свою ответственность за военные поражения летом – осенью 1993 года, объясняя это тем, что у него не было полномочий для организации обороны страны, он был отстранён от военных вопросов и занимался только экономикой830. Данное высказывание вызывает вопросы. Как показывают факты, летом – осенью 1993 г. С. Гусейнов активно занимался военными вопросами. 12 июля 1993 г. в Гяндже под руководством С. Гусейнова было проведено расширенное заседание командного состава вооружённых сил республики, в котором участвовали министры, начальники управлений, представители власти. Было
